青海省水产研究所是我省唯一的水产科研机构，隶属青海省水产局领导，初建于1960年，当时有职工41人，其中，专业技术人员16人，工人25人。1962年国民经济调整时予以撤消，机构改为水产养殖试验场。1979年重新恢复了青海省水产研究所的建制。1998年编委同意成立“青海省养殖鱼类病害防治中心”，挂靠水产研究所内。
水产研究所位于西宁市南郊，地处南川河西岸沈家寨境内，占地面积126.6亩。有776.4平米的办公、实验综合楼一幢，600平米的孵化温室一处。另有试验鱼地18个，水面近50亩，鱼饲料加工机械一套，各种排灌及鱼池增氧机械22台。
研究所下设机构有：青海省养殖鱼类病害防治中心，渔用水质监测站，养殖试验场、鱼用饲料加工场、图书室、办公室、仪器室、标本室和渔业资源室等10个部门。
青海省水产研究所主要承担全省渔业科研(应用研究，应用基础研究和先进实用技术的示范)；全省养鱼类病虫害检疫和防治；渔用水质监测；渔业资源调查(特别是盐湖生物资源的调查与开发研究)，还承担水产养殖鱼类品种的引进、试养和土著经济鱼类优良品种的驯化、试养和苗种繁育技术的研究及开发，鉴于青海省独特的地理、气候、水文条件、青海省水科研究所承担水体环境的监测工作。随着市场经济的发展，该所开始进行渔业生产标准化工作，鱼苗、鱼种生产的操作规程。研究所还承担养殖鱼业和群众养鱼技术培训和技术资询服务工作。
1979年恢复建制，随着我国经济的不断发展，我所先后承得完成了联合国粮农组织的援助项目，农业部和省科委下达的科研项目30余项，较全面了解和掌握了我省水产资源状况，为我省渔业的发展提供宝贵的科学依据。我所独立和合作出版的书籍有10本。国内期刊杂志发表了近百篇论文。为我省制定了二项省级标准，为我省水科养殖成功地引进了十余个养殖品种，是我省池塘养鱼产业第一个创千斤的单位，在我省水科行业中始终起着领头羊的作用。
利用我所科技力量优势，协助乐都、贵德、循化及西宁地区建立了商品鱼基地在乐都和西宁建立养鱼示范户，为群众养鱼进行技术咨询和技术服务，定期举办养鱼实用技术培训班等。为我省渔业发展做出了巨大贡献。
水产研究所的方向任务除为当前、当地的渔业发服务、测重于近期的应用和开发研究(渔业资源调查及开发利用的研究、水产养殖病害的防治、水产养殖吕种的引进、繁育、试养及养殖先进技术的应用研究、水产科技咨询和技术服务)外，由于三江源地区生态环境的不断恶化，渔业资源已遭到严重破坏、生物多样性受到威胁，为此，对江河源地区的渔业资源进行调查，摸清现有资源状况，制定合理恢复和保护措施及江河源地区的经济水生生物的调查、驯养技术研究增加新的养殖品种，寻找高源渔业新的增长点已迫在眉睫，也是我所今后重点研方向。同时，积极开展人工养殖，使我省渔业总水平保持较好发展势头，使我省渔业走可持续发展的道路。
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